Mikor fedezték fel a cink ujjak nukleázait?
Pontszám: 4,1/5 ( 21 szavazat )A cink ujjakat 1985 -ben fedezték fel, a Xenopus fehérje IIIA transzkripciós faktor (TFIIIA) és az 5S RNS kölcsönhatására vonatkozó biokémiai vizsgálataink értelmezéséből. A későbbi szerkezeti vizsgálatok feltárták háromdimenziós szerkezetét és kölcsönhatását a DNS-sel.
Ki fedezte fel a cink ujját?
1982 őszén Miller , egy frissen végzett hallgató, megkezdte tanulmányait a TFIIIA-n. Ez egy figyelemreméltó ismétlődő motívum felfedezéséhez vezetett a fehérjében, amelyet később a laboratóriumi szakzsargonban cink ujjnak neveztek, mivel cinket (Zn) tartalmazott, és megragadta vagy megragadta a DNS-t (6).
Ki fedezte fel a ZFN-eket?
2003-ban Mathew Porteus David Baltimore laboratóriumában közzétett egy géncélzó riporter rendszert tenyésztett emberi sejtekben, amely egy mutáns GFP gén HDR-jén alapul, amelyet egy ismert szekvencia-specifitású háromujjas ZFN célpontja szakított meg [73].
Mi az a cink ujj nukleáz?
A cinkujj-nukleázok (ZFN-ek) olyan mesterséges restrikciós enzimek, amelyeket úgy terveztek, hogy megcélozzák a genomon belüli specifikus DNS-szekvenciákat . A cinkujj DNS-kötő doménjének DNS-hasítási doménhez való összeszerelése lehetővé teszi az enzimrendszer számára, hogy a genomban egyedi lókuszt célozzon meg, és endogén DNS-javító mechanizmusokat idézzen elő.
Hol található a cink ujj?
Ennek az osztálynak a kanonikus tagjai egy kétmagvú cinkklasztert tartalmaznak, amelyben két cinkion hat cisztein-maradékhoz kötődik. Ezek a cink ujjak számos transzkripciós faktorban megtalálhatók, beleértve az élesztő Gal4 fehérjét .
CINK UJJ NUKLEÁZOK – A GÉNSZERKESZTÉS MAGÁZAT!
Mi értelme van a cinkujjaknak?
A cink-ujj fehérjék (ZNF-ek) számos sejtfolyamatban vesznek részt, különböző molekuláris mechanizmusokon keresztül. A ZNF-ek kulcsszerepet játszanak számos szövet fejlődésében és differenciálódásában. A ZNF-ek részt vesznek a daganatképződésben, a rák progressziójában és a metasztázisok képződésében .
Hogyan működik a cink ujj?
Amint ezekből a struktúrákból látható, a cinkujjak lánca a DNS- vagy RNS-szálak mentén görbül , megkötődik a barázdákban, és befelé nyújtja az aminosavakat, hogy leolvassa a bázisokat. Egyetlen cinkujj nem köt túl szorosan, és csak 2 vagy 3 bázispárt tud felismerni.
A cink ujjak transzkripciós faktorok?
A cink ujjfehérjék a legnagyobb transzkripciós faktorcsalád az emberi genomban . A cinkujj-motívumok változatos kombinációi és funkciói sokoldalúvá teszik a cinkujj fehérjéket a biológiai folyamatokban, beleértve a fejlődést, a differenciálódást, az anyagcserét és az autofágiát.
Mi a cink ujj nukleázok két doménje, ZFN)?
A célzó reagensek osztálya, amely az elmúlt években a legsokoldalúbbnak és leghatékonyabbnak bizonyult, a cink-ujj nukleázoké (ZFN), amelyek külön DNS-kötő és DNS-hasító doménnel rendelkeznek (3. és .
Hogyan kötődnek a cink ujjak a DNS-hez?
A cinkujjak a DNS fő barázdájában kötődnek, a szálak köré tekeredve, és a specifitást több aminosav oldalláncai biztosítják az α-hélixeken. Egyes cinkujjfehérjék hidrofób kölcsönhatások vagy ujj-ujj kötődés révén homodimerizálódnak, és megerősítik a DNS-hez való specifikus kötődést.
Miért léteznek nukleázok?
A nukleázok különféleképpen befolyásolják a célmolekuláik egy- és kétszálú töréseit . Az élő szervezetekben ezek a DNS-javítás számos aspektusának alapvető gépei. Bizonyos nukleázok hibái genetikai instabilitást vagy immunhiányt okozhatnak. A nukleázokat széles körben alkalmazzák a molekuláris klónozásban is.
Mikor találták fel a TALEN-t?
Laboratóriuma a szekvencia-specifikus nukleázok kiváló osztályát fejlesztette ki – a transzkripciós aktivátorszerű effektornukleázokat (TALEN) –, amelyeket a Science magazin 2012 tíz legnagyobb tudományos áttörése közé sorolt. Cas9/CRISPR alapú nukleázokat használva Dr.
Mit jelent a sgRNS?
Az sgRNA a „ single guide RNA ” rövidítése. Ahogy a név is sugallja, az sgRNS egyetlen RNS-molekula, amely tartalmazza mind az egyedi tervezésű, rövid crRNS-szekvenciát az állvány tracrRNS-szekvenciájához fuzionálva. Az sgRNS szintetikusan előállítható, vagy előállítható in vitro vagy in vivo DNS-templátból.
Melyik fehérje tartalmaz cink ujj domént?
A cink ujj domének az egyik leggyakoribb szerkezeti motívumok az eukarióta sejtekben, amelyek a motívumot alkalmazzák néhány legfontosabb fehérjéjükben (beleértve a TFIIIA-t, a CTCF-et és a ZiF268-at) . Ezek a DNS-kötő fehérjék legfeljebb 37 cink ujj domént tartalmaznak, amelyeket rugalmas linker régiók kötnek össze.
Mennyi cinkre van szükség a szervezetben?
Az ajánlott napi cinkmennyiség 8 milligramm (mg) nőknek és 11 mg felnőtt férfiaknak.
Mi az a cinkkötő hely?
Ez a típusú cinkkötő hely aminosav ligandumokból áll, amelyek a kötőfelületen találhatók két fehérje alegység vagy kölcsönhatásba lépő fehérje között (2. ábra). A kapott hely továbbra is megőrzi az első három azonosított hely funkcionális tulajdonságait. Cinkkötő helyek a fehérjékben, ábra.
Használnak még ZFN-eket?
Míg a ZFN-ek általában nem léteznek dimer formában , a kötőhely felismerésekor dimerizálódnak.
Miben jobb a CRISPR, mint a TALEN?
Ellentétben a CRISPR-rel, amely több génmutációt tud bevinni egyidejűleg egyetlen injekcióval, a TALEN-ek egyszerű mutációkra korlátozódnak . A CRISPR transzfekciók hatékonysága is magasabb, míg a TALEN szerkesztés gyakran mozaikosodást eredményez, ahol a mutáns allél csak néhány transzfektált sejtben van jelen.
Hogyan segít a cinkatom stabilizálni a cinkujjat?
A cinkatomot egyidejűleg köti a 2 cisztein és a 2 hisztidin oldallánc. A DNS-nek negatív töltésű foszfátváza van. Ezért a cinkujj pozitív töltésű argininje elektrosztatikus kölcsönhatáson keresztül kötődhet a DNS-hez.
Dimerizálódhatnak a cink ujjak?
A C2H2 cinkujj a legelterjedtebb fehérjemotívum az emlős proteomjában. ... Itt megmutatjuk, hogy ezek az ujjak jóhiszemű dimerizációs tartományt tartalmaznak.
A fehérjék tartalmaznak cinket?
A Zn fehérjék ezért mind a 6 Enzyme Commission (EC) osztályban megtalálhatók, és a legújabb becslések szerint az összes eukarióta fehérje közel 10%-a Zn-függő [26,27].
Mi a cink átírása?
Modern IPA: zɪ́ŋk . Hagyományos IPA: zɪŋk. 1 szótag: "ZINK"
A cink ujj másodlagos szerkezet?
Az „ujj” a másodlagos struktúrákra (α-hélix és β-lemez) utal, amelyeket a Zn-ion tart össze. A cink ujjat tartalmazó domének jellemzően interaktorként szolgálnak, DNS-t, RNS-t, fehérjéket vagy kis molekulákat kötve (Laity et al., 2001).
Hogyan szabályozzák a cink ujjak a transzkripciót?
Először is, a Zap1 transzkripciós autoregulációval szabályozza saját expresszióját. Másodszor, a cink szabályozza a Zap1 DNS-kötő aktivitását . A Zap1 túlzott expressziója felülírja a DNS-kötés szabályozását, és konstitutív ZRE-foglaltságot eredményez.
Mik azok a cink ujjak és a leucin cipzárok?
A leucin cipzárak olyan α-hélixek, amelyek minden hetedik aminosavban tartalmaznak egy leucin-maradékot . Ez a motívum számos eukarióta transzkripciós faktorban megtalálható. A cink ujjak 25-30 aminosavból állnak, amelyek egyetlen cinkatomot vesznek körül, amelyet két cisztein koordinál, amelyek nagyon közel állnak a rövid α-hélixekhez.