Mit csinál a Bionano genomika?

A Bionano Genomics, Inc. platformot biztosít a genomi DNS hosszú szakaszainak és más biomolekulák szerkezeti változatainak elemzésére . A Társaság szabadalmaztatott nanocsatornás chipeket, automatizált képalkotó műszert, integrált elsődleges és másodlagos szoftvert, valamint alkalmazásspecifikus reagenseket kínál.

Mennyibe kerül a Hi-C?

A fő DLO Hi-C kísérlet mindössze 20–29 óra alatt elvégezhető, és körülbelül 92 dollárba kerül . Sikeresen alkalmaztuk ezt a technológiát a 3D genom tájképének és kromoszómális transzlokációinak vizsgálatára, és kimutattuk, hogy ez az egyszerű és költséghatékony technológia nagymértékben javítja a jel-zaj arányt.

Mire használható a Hi-C?

A Hi-C jelenleg a legszélesebb körben használt vizsgálati módszer a genom 3D-s szerveződésének vizsgálatára, valamint a génszabályozásban, a DNS-replikációban és a betegségekben betöltött szerepének tanulmányozására .

Mi a leggyakrabban használt ChIP szekvenálás mérésére?

Felhasználások. A ChIP-seq-et elsősorban annak meghatározására használják, hogy a transzkripciós faktorok és más kromatinhoz kapcsolódó fehérjék hogyan befolyásolják a fenotípust befolyásoló mechanizmusokat . Számos biológiai folyamat és betegségi állapot teljes megértéséhez elengedhetetlen annak meghatározása, hogy a fehérjék hogyan lépnek kölcsönhatásba a DNS-sel a génexpresszió szabályozása érdekében.

Mi az in situ Hi-C?

Az in situ Hi-C egy módszer a kromoszómarégiók közötti páronkénti kölcsönhatások kimutatására és számszerűsítésére a teljes genomban . 2014-ben fejlesztették ki a hígításos Hi-C módszer továbbfejlesztéseként.

Mi a célja a kromoszóma konformáció rögzítésének?

A kromoszóma konformáció rögzítésén (3C) alapuló módszerek a kromatin mentén lévő pontpárok fizikai közelségének meghatározásával tárják fel a magon belüli kromoszóma szerveződést . Megőrzik a kromatin kölcsönhatásokat keresztkötésekkel, majd fragmentációval, ligálással és a kölcsönhatásba lépő régiók szekvenálásával.

Mi a C kromoszóma?

A DNS-tartalom 2C, ahol a C a haploid kromoszómakészletben jelenlévő DNS tömege . A férfi (XY) kariotípus [bal fent] egy pár nemi kromoszómából áll, egy metacentrikus és egy telocentrikus (egy karral), valamint ugyanazzal az autoszóma komplementtel, mint a női.

Mi az a Hi-C genomika?

Arima Genomics Hi-C technológia Az Arima-HiC egy proximity ligációs módszer , amely megragadja a kromatin háromdimenziós (3D) szervezeti struktúráját, ahol az egymástól lineáris távolságban disztálisan elhelyezkedő genomiális szekvenciák közelebb kerülhetnek egymáshoz a 3D térben. .

Mi az a Capture C?

A Capture-C a kromoszóma-konformáció-rögzítés kísérleti módszerek családjának tagja, amely a sejtmagban lévő kromoszómák 3D-s szerveződését vizsgálja .

Mi az a CTCF kötőhely?

A CTCF DNS-szálakat köt össze , így kromatin hurkokat hoz létre, és a DNS-t olyan sejtszerkezetekhez rögzíti, mint a nukleáris lamina. Meghatározza az aktív és a heterokromatikus DNS közötti határokat is. ... A CTCF-kötésről kimutatták, hogy elősegíti és elnyomja a génexpressziót.

Mi az a 4C szekvenálás?

A 4C-seq egy származékos 3C módszer, amelyet arra terveztek, hogy a genomban olyan szekvenciákat keressen, amelyek érintkezésbe kerülnek egy kiválasztott genomiális hellyel . ... Korlátozott mennyiségű szekvenálási leolvasás alapján nagy felbontású kontaktprofilokat hoz létre a kiválasztott genomiális helyekhez. A 4C-seq felhasználható a genom szerveződésének többféle aspektusának tanulmányozására.

Mire használható a ChIP elemzés?

A ChIP assay nagyon népszerű eszközzé vált a kromatin szerkezetének és a transzkripcióban szerepet játszó nukleáris események tanulmányozásában . Számos fontos DNS-kötő fehérje és szabályozó enzimje célgénjeinek azonosítására használták.

Mi a bemenet a ChIP vizsgálatban?

Ezzel a módszerrel a ChIP-ről kapott jeleket felosztják a bemeneti mintából származó jelekkel. Ez a bemeneti minta a ChIP-ben használt kromatin mennyiségét mutatja . ... Általában a kiindulási kromatin 1%-át használják bemenetként.

Hogyan elemzi a ChIP-seq adatokat?

A Hi-C jó neked?

V: Minden bizonnyal van néhány népszerű ital, amelyet kerülnie kell a gyerekeinek. Alacsony a tápanyagtartalmuk, és tele vannak cukorral. ... Hi-C®: Ez a régi kedvenc kevés gyümölcslevet tartalmaz, ─ mindössze 10% ─, de magas hozzáadott cukrot tartalmaz . Egy 6,75 unciás kartondobozban 6 teáskanál cukor van.

Mi az a Hi-C kapcsolati térkép?

A Hi-C adatok kétdimenziós kontakttérképek formájában vannak, azaz olyan mátrixok, amelyek i,j bemenete számszerűsíti a két genom i és j régió közötti fizikai kölcsönhatás intenzitását DNS szinten.

Hány Hi-C íz létezik?

Jelenleg három Hi-C termékcsalád létezik: az italdoboz, a Hi-C Blast és a Hi-C Sour Blast. A Hi-C termékek színe korábban az ízükből fakadt, de 2002-ben a Hi-C-t újra bevezették, mint sárgás, átlátszó italt, amely nem szennyezi be a ruhát.

Miért távolította el a McDonald's a Hi-C-t?

(Az ital teljes hivatalos neve valójában Hi-C Orange Lavaburst, amit valószínűleg a legtöbben nem tudtunk.) A Coke-val kötött új együttműködés miatt az italt Sprite TropicBerry szódával helyettesítik. A McDonald's képviselője megerősítette a hírt az Eat This Not That weboldalnak.

A McDonald's visszahozza az Orange Hi-C-t?

Visszatért! Februárban a McDonald's bejelentette, hogy négy évvel azután, hogy eltávolították az étlapról, a Hi-C Orange Lavaburst újra bevezeti az italszökőkútba az éttermekben országszerte . ... Az élénk színű és sokak által kedvelt ital hivatalos visszaküldési dátuma.

Miért szüntette meg a McDonald's a narancssárga Hi-C-t?

Múlt év áprilisában beszámoltunk arról, hogy az alkalmazottaknak címzett feljegyzésben a McDonald's az italt egy "új alapitalra" cseréli a Coke-val kötött új partnerség miatt , de a Hi-C Orange Lavaburst örökre a kínálatban marad. szívünk.