Tömeges szegregáns elemzéssel?
Pontszám: 4,3/5 ( 71 szavazat )A tömeges szegregáns elemzés (BSA) egy olyan technika, amelyet a mutáns fenotípushoz kapcsolódó genetikai markerek azonosítására használnak . Ez lehetővé teszi a genetikusok számára, hogy felfedezzenek olyan géneket, amelyek betegségrezisztenciát vagy fogékonyságot biztosítanak. Ez a technika magában foglalja két olyan csoport kialakítását, amelyek ellentétes fenotípusokat mutatnak egy érdekes tulajdonság tekintetében.
Mi a haszna a tömeges szegregáns elemzési stratégiának a főbb géntérképezésben?
A tömeges szegregáns analízist (BSA) alkalmazták számos agronómiai tulajdonság feltérképezésére számos növényben , beleértve a gombakórokozókkal szembeni rezisztenciagéneket. Diploid utódokban BSA-t használva azt javasolták, hogy a citrusfélék ABS-rezisztenciájának öröklődését egyetlen recesszív allél szabályozza (Dalkilic és mtsai, 2005).
Mit jelent a tömeg a genetikában?
Kétféleképpen lehet tömeges mintát venni a mintákból. A fenotípusos szélsőségekből vett szöveteket először egyesítik, majd egyetlen DNS/RNS/fehérje izolálást végeznek; vagy először a DNS/RNS/fehérje izolálása minden szélsőséges egyedből, majd minden egyes egyedből azonos mennyiségű extrakciót gyűjtenek össze .
Mi az a szegregáns?
szegregáns a brit angol (ˈsɛɡrɪɡənt) genetikában. főnév. olyan szervezet, amely a szegregáció miatt különbözik . melléknév. a szegregáció miatt különbözik a szülőtől.
Mi az a delta SNP index?
A pozitív delta SNP index azt jelzi, hogy a nem referencia allél (ICCV 96029) hozzájárul a tulajdonsághoz , míg a negatív delta SNP index azt mutatja, hogy a referencia allélok (CDC Frontier) hozzájárulnak a tulajdonsághoz. Csak a jelentős QTL régiókkal rendelkező kromoszómák láthatók.
Tömeges szegregáns elemzés – 1. rész: Koncepció és felépítés
Mi az a QTL seq?
A Quantitative trait locus (QTL)-Seq egy olyan módszer, amely a tömeges szegregáns elemzést (BSA) és a nagy áteresztőképességű teljes genom újraszekvenálást kombinálja egy bizonyos kvantitatív tulajdonság fő lókuszának kimutatására egy szegregáló populációban.
Mi az a genetikai finomtérképezés?
A finomtérképezés az a folyamat, amelynek során egy genom-szintű asszociációs vizsgálatból (GWAS) származó tulajdonsághoz kapcsolódó régiót elemeznek, hogy azonosítsák azokat az adott genetikai változatokat, amelyek valószínűleg okozatilag befolyásolják a vizsgált tulajdonságot.
Mi a szegregáció helyes meghatározása?
1: a szegregáció aktusa vagy folyamata: a szegregáció állapota. 2a : egy faj, osztály vagy etnikai csoport elválasztása vagy elszigeteltsége korlátozott területen való kényszerű vagy önkéntes tartózkodással, a társadalmi érintkezés akadályozásával, külön oktatási létesítményekkel vagy más megkülönböztető eszközökkel.
Hogyan történik a tömeges szegregáns elemzés?
A tömeges szegregáns elemzés (BSA) egy olyan technika, amelyet a mutáns fenotípushoz kapcsolódó genetikai markerek azonosítására használnak . Ez lehetővé teszi a genetikusok számára, hogy felfedezzenek olyan géneket, amelyek betegségrezisztenciát vagy fogékonyságot biztosítanak. Ez a technika magában foglalja két olyan csoport kialakítását, amelyek ellentétes fenotípusokat mutatnak egy érdekes tulajdonság tekintetében.
Mi az egymarker elemzés?
Az egymarker-elemzés a kvantitatív vonási lokusz (QTL) elemzési technikák sorozatának egyike, amely képes kimutatni a molekuláris markerek és a növénynemesítők számára érdekes tulajdonságok közötti összefüggéseket , mint például a betegségekkel szembeni rezisztenciát, a megnövekedett terméshozamot és a jobb gyümölcsminőséget.
Mi az izogén vonalak közelében?
A közel izogén vonalak (NIL-ek) olyan törzsek, amelyek genetikai felépítése néhány specifikus hely vagy genetikai lókusz kivételével azonos (Muehlbauer és mtsai, 1988; Young és mtsai, 1988).
Mi az előnye a molekuláris asszisztált szelekciónak?
Ha egy tulajdonság megbízható markere elérhető, a MAS nagyobb előrehaladást eredményezhet, mint a fenotípusos szelekció ilyen helyzetben. A tulajdonságtól függően a MAS olcsóbb és gyorsabb lehet, mint a hagyományos fenotípusos vizsgálatok.
Hogyan működik a jelölővel segített kiválasztás?
A marker-asszisztált tenyésztés a kívánt tulajdonságokhoz kapcsolódó DNS-markereket használ, hogy kiválasszon egy növényt vagy állatot a tenyésztési programba való felvételhez a fejlődés korai szakaszában . ... Ez a genetikai teszt segít a tenyésztőknek a szarv nélküli szarvasmarhák kiválasztásában, ami biztonságosabbá teszi az állatokat és az őket kezelő embereket.
Mi az a genetikai introgresszió?
Az introgresszió, más néven introgresszív hibridizáció a genetikában az egyik faj genetikai anyagának átvitele egy másik faj génállományába, egy interspecifikus hibridnek az egyik szülőfajjal való ismételt visszakeresztezésével .
Mi az a GWAS üzem?
A genomszintű asszociációs vizsgálatok (GWAS) hatékony eszközt jelentenek bármely egyszeri vagy többszörös stresszhez kapcsolódó többszörös vagy összetett tulajdonságok vizsgálatára. A különböző növényeken/növényeken végzett GWAS új génjelölteket vagy géneket vagy kvantitatív tulajdonságlókuszokat azonosított, amelyek felelősek az abiotikus stresszért és a biotikus stresszért.
Hogyan használhatók az egész genomra kiterjedő asszociációs vizsgálatok?
A genomszintű asszociációs vizsgálat (GWAS) egy olyan megközelítés, amelyet a genetikai kutatásban használnak, hogy specifikus genetikai variációkat társítsanak bizonyos betegségekhez . A módszer magában foglalja számos különböző ember genomjának szkennelését, és olyan genetikai markerek keresését, amelyek segítségével előre megjósolható a betegség jelenléte.
Mi a példa a szegregációra?
A szegregáció az elválasztás aktusa, különösen, ha az emberek faj szerinti elkülönítésére alkalmazzák. A szegregációra példa az, amikor az afroamerikai és kaukázusi gyerekeket különböző iskolákba kényszerítették .
Melyek a szegregáció különböző típusai?
A szegregáció két dimenzióból áll: vertikális szegregációból és horizontális szegregációból .
Mit jelent a szegregáció magyarázata példával?
A szegregáció magában foglalhatja a tételek egy nagyobb csoporttól való elkülönítését is. Például egy brókercég elkülönítheti a pénzeszközök kezelését bizonyos típusú számlákon, hogy elkülönítse forgótőkéjét az ügyfelek befektetéseitől .
Hogyan történik a géntérképezés?
Az STS-ek halmazának feltérképezéséhez egyetlen kromoszómából vagy a teljes genomból származó átfedő DNS-fragmensek gyűjteményére van szükség . Ehhez először a genomot töredékekre bontják. A fragmentumokat ezután akár 10-szer replikálják bakteriális sejtekben, hogy létrehozzák a DNS-klónok könyvtárát.
Hogyan történik a QTL leképezés?
A QTL-ek feltérképezése annak azonosításával történik, hogy mely molekuláris markerek (például SNP-k vagy AFLP-k) korrelálnak egy megfigyelt tulajdonsággal . Ez gyakran egy korai lépés a tulajdonság variációját okozó tényleges gének azonosításában és szekvenálásában.
Mi az a feltételes elemzés?
A feltételes analízist eszközként használták a másodlagos asszociációs jelek azonosítására a 3. , 9. , 10. lókuszban, beleértve az asszociációs analízis kondicionálását az elsődleges asszociált SNP-n a lókusznál, hogy teszteljék, vannak-e más, szignifikánsan asszociált SNP-k.
Mi a különbség az SSR és az SNP között?
Összehasonlításunk azt mutatja, hogy az SSR-ek magasabb per-locus információtartalma teszi őket a szülői és hozzárendelési tanulmányok választott jelzőjévé, míg az SNP-k megbízhatóbb demográfiai következtetéseket adnak (N e és egy közelmúltbeli szűk keresztmetszet kimutatása).
Hogyan működik a genomika?
A genomika az élőlények teljes genomjának tanulmányozása , és genetikai elemeket tartalmaz. A Genomics a rekombináns DNS, a DNS-szekvenálási módszerek és a bioinformatika kombinációját használja a genomok szerkezetének és működésének szekvenálására, összeállítására és elemzésére.
Melyik marker a legjobb a jelölővel segített kiválasztáshoz?
A DNS-markerek nélkülözhetetlen eszközei voltak a genetikai erőforrások jellemzésében, és a tenyésztők számára részletesebb információkkal látták el a szülők kiválasztását. Egyes esetekben nagyon kívánatos a tenyészanyagon belüli specifikus lókuszra (pl. specifikus rezisztenciagénre vagy QTL-re) vonatkozó információ.