Korrigált p értékkel?
Pontszám: 4,4/5 ( 20 szavazat )A korrigált P érték az a legkisebb családi szignifikancia szint, amelynél egy adott összehasonlítást statisztikailag szignifikánsnak nyilvánítanak a többszörös összehasonlítási teszt részeként . ... A rendszer minden egyes összehasonlításhoz külön korrigált P értéket számít ki egy összehasonlításcsaládban.
Hogyan számítja ki a korrigált p-értéket?
Vladimir Cermak javaslatát követve, manuálisan hajtsa végre a számítást a következővel: korrigált p-érték = p-érték* (a tesztelt hipotézisek teljes száma)/(a p-érték rangsorolása) , vagy használja az R-t Oliver Gutjahr javaslata szerint, p.
Mi a korrigált p-érték vs p-érték?
A különbség egy másik módja az, hogy a 0,05 p-érték azt jelenti, hogy az összes teszt 5%-a téves pozitív eredményt ad. Az FDR által korrigált 0,05-ös p-érték (vagy q-érték) azt jelenti, hogy a szignifikáns tesztek 5%-a téves pozitív eredményt ad . Ez utóbbi kevesebb téves pozitív eredményt eredményez.
Miért állítjuk be a p-értékeket?
Az ANOVA-ban többszörös összehasonlításhoz használja, a korrigált p-érték azt jelzi, hogy az összehasonlítások családján belül (hipotézis tesztek) mely faktorszintű összehasonlítások különböznek szignifikánsan . Ha a korrigált p-érték kisebb, mint az alfa, akkor elutasítja a nullhipotézist.
Hogyan számítják ki a Bonferroni korrigált p-értéket?
A Bonferroni által korrigált/korrigált p érték megszerzéséhez ossza el az eredeti α-értéket a függő változó elemzéseinek számával .
A False Discovery Rates, FDR, egyértelműen elmagyarázva
Mit jelent a korrigált p-érték?
A korrigált P érték az a legkisebb családi szignifikancia szint, amelynél egy adott összehasonlítást statisztikailag szignifikánsnak nyilvánítanak a többszörös összehasonlítási teszt részeként . ... A rendszer minden egyes összehasonlításhoz külön korrigált P értéket számít ki egy összehasonlításcsaládban.
Hogyan csökkenti a p-értéket?
Ha növeljük a minta méretét, csökkentjük a standard hibát, vagy növeljük a minta statisztika és a feltételezett paraméter közötti különbséget , a p érték csökken, így valószínűbb, hogy elvetjük a nullhipotézist.
Be kell állítanom a p-értékemet?
A p-érték kiigazítására akkor van szükség, ha többszörös összehasonlítást vagy általánosabb értelemben vett többszörös tesztelést végeznek: több szignifikanciatesztet hajtanak végre, ahol csak egy szignifikáns eredmény egy átfogó hipotézis elutasításához vezet.
Mi az FDR p-értéke?
Az FDR az az arány, amelynél a jelentősnek nevezett szolgáltatások valóban nullák . Az 5%-os FDR azt jelenti, hogy a szignifikánsnak nevezett jellemzők közül ezek 5%-a valóban nulla. Ahogy az alfát állítjuk be a p-érték küszöbértékeként az FPR szabályozásához, úgy beállíthatunk egy küszöböt a q-értékhez is, amely a p-érték FDR analógja.
Mi a korrigált p-érték?
A Bonferroni által korrigált p-értékek kezelik a többszörös tesztelési problémát azáltal, hogy szabályozzák a „családi hibaarányt”: legalább egy hamis pozitív hívás végrehajtásának valószínűségét. Ezeket úgy számítják ki, hogy az eredeti p-értékeket megszorozzák az elvégzett tesztek számával .
Hogyan számítja ki a DESeq2 a p-értéket?
A DESeq2-ben a Wald-teszt által elért p-értékek alapértelmezés szerint a Benjamini- és Hochberg-módszerrel korrigálódnak többszörös tesztelésre . Lehetőség van más módszerek használatára is az results() függvényben. A p-korrigált értékeket kell használni a jelentős gének meghatározásához.
Mi a p-érték és a Q-érték?
A p-érték egy terület az eloszlás végében, amely megmondja annak esélyét, hogy egy eredmény véletlenül bekövetkezik. A Q-érték egy p-érték, amelyet a False Discovery Rate (FDR) szerint korrigáltak .
Mi az a korrigálatlan p-érték?
A korrigálatlan p érték egyetlen voxel nullhipotézisére vonatkozik , így a korrigálatlan p értékeknek csak akkor van hasznos jelentése, ha a regionális hipotézis csak egy voxelre vonatkozik. Gyakrabban van egy hipotézisünk egy bizonyos agyi régióról, amely egynél több voxelt tartalmaz.
Mi az a BH korrigált p-érték?
A BH-val korrigált p-értékek a következőképpen vannak definiálva: pBH(i)=min{minj≥i{mp(j)j},1} . Ez a képlet bonyolultabbnak tűnik, mint amilyen valójában. Azt mondja: Először is rendezze az összes p-értéket kicsitől a nagyig. Ezután szorozzuk meg minden p-értéket az összes m teszt számával, és osszuk el a sorrendjükkel.
A kritikus érték megegyezik a p-értékkel?
A p-érték, a kritikus érték és a tesztstatisztika közötti kapcsolat. Mint tudjuk, a kritikus érték egy olyan pont, amelyen túlmenően elvetjük a nullhipotézist. Másrészt a P-érték a megfelelő statisztika (Z, T vagy chi) jobb oldalán lévő valószínűség.
Mi az a benjamini Hochberg korrigált p-érték?
A Benjamini-Hochberg eljárás egy hatékony eszköz, amely csökkenti a hamis felfedezések arányát. Az arány beállítása segít ellenőrizni azt a tényt, hogy néha véletlenül előfordulnak kis p-értékek (kevesebb, mint 5%) , ami a valódi nullhipotézisek helytelen elutasításához vezethet.
Mit mond el a p-érték a statisztikai szignifikanciáról?
A 0,05-nél kisebb p-érték (tipikusan ≤ 0,05) statisztikailag szignifikáns. Erős bizonyítékot jelez a nullhipotézis ellen, mivel 5%-nál kisebb a valószínűsége, hogy a nulla helyes (és az eredmények véletlenszerűek). Ezért elvetjük a nullhipotézist, és elfogadjuk az alternatív hipotézist.
Mi a jó FDR érték?
Maradjon < 0,05 az FDR-nél. Az a jó a hamis felfedezési arányban (FDR), hogy világos, könnyen érthető jelentése van. Ha 0,1-es (10%) FDR-értékkel vág, akkor a jelentős találatok listáján (várhatóan) legfeljebb 10% hamis pozitív eredmény található.
Mit jelent az FDR?
FDR vagy Franklin D. Roosevelt (1882–1945) az Egyesült Államok 32. elnöke volt, 1933 és 1945 között töltötte be hivatalát.
A p-érték megegyezik az Alfával?
Az alfa, a szignifikanciaszint annak a valószínűsége, hogy Ön elköveti azt a hibát, hogy elutasítja a nullhipotézist, miközben az igaz. A p-érték azt méri, hogy mekkora valószínűséggel kapunk szélsőségesebb értéket, mint amit a kísérletből kaptunk. ... Ha kisebb, mint alfa, akkor elutasítja a nullhipotézist.
Hogyan változtatja meg a p-értéket R-ben?
A ' o. Az igazítás ( )' parancs az R-ben kiszámolja a korrigált p-értékeket a nem korrigált p-értékek halmazából, számos beállítási eljárás segítségével. A családi hibaarány erős szabályozását biztosító korrekciós eljárások a Bonferroni, Holm, Hochberg és Hommel eljárások.
Mi a baj a Bonferroni beállításával?
Az első probléma az, hogy a Bonferroni-korrekciók rossz hipotézisre vonatkoznak. ... Ha a 20 P érték közül egy vagy több kisebb, mint 0,00256, az univerzális nullhipotézist elvetik . Azt mondhatjuk, hogy a két csoport nem egyenlő mind a 20 változóra, de azt nem tudjuk megmondani, hogy melyik, sőt hány változó különbözik egymástól.
A P érték hatásmérete?
Míg a P érték tájékoztathatja az olvasót, hogy létezik-e hatás, a P érték nem fedi fel a hatás méretét . A vizsgálatok jelentésében és értelmezésében mind a szubsztantív szignifikancia (hatásméret), mind a statisztikai szignifikancia (P-érték) lényeges jelentendő eredmény.
Miért rossz a p érték?
Az alacsony P-érték azt jelzi, hogy a megfigyelt adatok nem egyeznek a nullhipotézissel , és ha a P-érték alacsonyabb, mint a megadott szignifikanciaszint (általában 5%), a nullhipotézist elvetik, és a megállapítást statisztikailag szignifikánsnak tekintik.
Miért olyan magas a p értékem?
A magas p-értékek azt jelzik, hogy az Ön bizonyítékai nem elég erősek ahhoz, hogy a populációra gyakorolt hatást jelezzék. Lehetséges, hogy létezik hatás, de lehetséges, hogy a hatás mérete túl kicsi, a minta mérete túl kicsi, vagy túl sok a variabilitás ahhoz, hogy a hipotézisvizsgálat észlelje.